Numpy 掩码数组

有时候数据集中存在缺失、异常或者无效的数值,我们可以标记该元素为被屏蔽(无效)状态。

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››› import numpy as np
››› import numpy.ma as ma
››› x = np.array([1, 2, 3, -99, 5])
››› x
array([  1,   2,   3, -99,   5])

现在可以创造一个掩码数组(标记第四个元素为无效状态)。

››› mx = ma.masked_array(x, mask=[0, 0, 0, 1, 0])
››› mx
masked_array(data = [1 2 3 -- 5],
 mask = [False False False True False],
 fill_value = 999999)

接下来可以计算平均值而不用考虑无效数据。

››› mx.mean()
2.75

    访问掩码

可通过其mask属性访问掩码数组的掩码。我们必须记住,掩码中的True条目表示无效数据。

››› mx
masked_array(data = [1 2 3 -- 5],
             mask = [False False False  True False],
       fill_value = 999999)

››› mx.mask
array([False, False, False,  True, False], dtype=bool)

    只访问有效数据

当只想访问有效数据时,我们可以使用掩码的逆作为索引。可以使用numpy.logical_not函数或简单使用~运算符计算掩码的逆:

››› x = ma.array([[1, 2], [3, 4]], mask=[[0, 1], [1, 0]])
››› x[~x.mask]
masked_array(data = [1 4],
             mask = [False False],
       fill_value = 999999)

另一种检索有效数据的方法是使用compressed方法,该方法返回一维ndarray(或其子类之一,取决于baseclass属性):

››› x.compressed()
array([1, 4])

    修改掩码

通过将True赋给掩码,可以立即屏蔽数组的所有数据:

››› x = ma.array([1, 2, 3], mask=[0, 0, 1])
››› x.mask = True
››› x
masked_array(data = [-- -- --],
             mask = [ True  True  True],
       fill_value = 999999)

最后,可以通过向掩码分配一系列布尔值来对特定数据条目进行掩码和/或取消掩码:

››› x = ma.array([1, 2, 3])
››› x.mask = [0, 1, 0]
››› x
masked_array(data = [1 -- 3],
             mask = [False  True False],
       fill_value = 999999)

    取消掩码

要取消屏蔽一个或多个特定数据条目,我们只需为它们分配一个或多个新的有效值:

››› x = ma.array([1, 2, 3], mask=[0, 0, 1])
››› x
masked_array(data = [1 2 --],
             mask = [False False  True],
       fill_value = 999999)
››› x[-1] = 5
››› x
masked_array(data = [1 2 5],
             mask = [False False False],
       fill_value = 999999)

要取消屏蔽掩码数组的所有掩码条目(假设掩码不是硬掩码),最简单的解决方案是将常量nomask分配给掩码:

››› x = ma.array([1, 2, 3], mask=[0, 0, 1])
››› x
masked_array(data = [1 2 --],
             mask = [False False  True],
       fill_value = 999999)
››› x.mask = ma.nomask
››› x
masked_array(data = [1 2 3],
             mask = [False False False],
       fill_value = 999999)

    索引和切片

由于MaskedArraynumpy.ndarray的子类,它会继承其用于索引和切片的机制。

当访问没有命名字段的被掩蔽数组的单个条目时,输出是标量(如果掩码的相应条目是False)或特殊值masked (如果掩码的相应条目为True):

››› x = ma.array([1, 2, 3], mask=[0, 0, 1])
››› x[0]
1
››› x[-1]
masked_array(data = --,
             mask = True,
       fill_value = 1e+20)
››› x[-1] is ma.masked
True

如果掩蔽的数组具有命名字段,访问单个条目将返回numpy.void对象(如果没有掩码),或者如果至少一个字段具有与初始数组相同的dtype的0d掩码数组的字段被屏蔽。

››› y = ma.masked_array([(1,2), (3, 4)],
...                mask=[(0, 0), (0, 1)],
...               dtype=[('a', int), ('b', int)])
››› y[0]
(1, 2)
››› y[-1]
masked_array(data = (3, --),
             mask = (False, True),
       fill_value = (999999, 999999),
            dtype = [('a', '‹i4'), ('b', '‹i4')])

当访问切片时,输出是掩蔽的数组,其data属性是原始数据的视图,并且其掩码是nomask(如果没有无效条目原始数组)或原始掩码的相应切片的副本。需要复制以避免将掩模的任何修改传播到原始版本。

››› x = ma.array([1, 2, 3, 4, 5], mask=[0, 1, 0, 0, 1])
››› mx = x[:3]
››› mx
masked_array(data = [1 -- 3],
             mask = [False  True False],
       fill_value = 999999)
››› mx[1] = -1
››› mx
masked_array(data = [1 -1 3],
             mask = [False  True False],
       fill_value = 999999)
››› x.mask
array([False,  True, False, False,  True], dtype=bool)
››› x.data
array([ 1, -1,  3,  4,  5])

访问具有结构化数据类型的掩蔽数组的字段会返回MaskedArray

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